A monitorização de mamíferos envolve uma variedade de abordagens e técnicas adaptadas às espécies de interesse. Através do contributo de plataformas de ciência cidadã, de câmaras de fotoarmadilhagem, armadilhas de captura, e análises de DNA foi detetada no concelho de Oeiras perto de uma dezena de espécies de mamíferos. Entre estas encontra-se o morcego-de-peluche (Miniopterus schreibersii) e o leirão (Eliomys quercinus), ambos classificados como Quase Ameaçado (NT). Existem ainda várias espécies carismáticas e protegidas por legislação internacional e normas comunitárias como a raposa (Vulpes vulpes), o golfinho-comum (Delphinus delphis), o ouriço-cacheiro (Erinaceus europaeus) e a geneta (Genetta genetta).